Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r194J3JS27 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms