Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ercc6F8VPZ5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6F8VPZ5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms