Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5218F6YH22 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5218F6YH22 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5218F6YH22 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5218F6YH22 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5218F6YH22 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5218F6YH22 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5218F6YH22 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5218F6YH22 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5218F6YH22 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5218F6YH22 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5218F6YH22 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5218F6YH22 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms