Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm8444F6XS56 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8444F6XS56 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8444F6XS56 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8444F6XS56 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8444F6XS56 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8444F6XS56 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8444F6XS56 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8444F6XS56 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8444F6XS56 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms