Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms