Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcb2A3KGF7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plcb2A3KGF7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms