Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited4Q9WUL8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms