Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syt6Q9R0N8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt6Q9R0N8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt6Q9R0N8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt6Q9R0N8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt6Q9R0N8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt6Q9R0N8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt6Q9R0N8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt6Q9R0N8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt6Q9R0N8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt6Q9R0N8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt6Q9R0N8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt6Q9R0N8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms