Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plod3Q9R0E1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms