Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndrg3Q9QYF9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndrg3Q9QYF9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndrg3Q9QYF9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndrg3Q9QYF9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndrg3Q9QYF9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndrg3Q9QYF9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndrg3Q9QYF9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndrg3Q9QYF9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndrg3Q9QYF9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms