Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx4Q9QY61 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms