Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PnkpQ9JLV6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms