Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cbx6Q9DBY5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx6Q9DBY5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.7 ms