Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Swt1Q9DBQ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Swt1Q9DBQ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms