Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgf29Q9DA08 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sgf29Q9DA08 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms