Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SlirpQ9D8T7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms