Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klhl40Q9D783 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms