Protein–RNA interactions for Protein: Q9D711

Pir, Pirin, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PirQ9D711 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PirQ9D711 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PirQ9D711 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PirQ9D711 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PirQ9D711 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PirQ9D711 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PirQ9D711 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PirQ9D711 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PirQ9D711 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PirQ9D711 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PirQ9D711 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PirQ9D711 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PirQ9D711 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PirQ9D711 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PirQ9D711 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PirQ9D711 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PirQ9D711 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms