Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ChtopQ9CY57 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms