Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem42Q9CR22 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem42Q9CR22 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms