Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ndufb5Q9CQH3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufb5Q9CQH3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb5Q9CQH3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms