Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsnaxip1Q99P25 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tsnaxip1Q99P25 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tsnaxip1Q99P25 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms