Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird2Q99NI3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird2Q99NI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird2Q99NI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird2Q99NI3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird2Q99NI3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms