Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TirapQ99JY1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms