Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN6

Ddx41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx41Q91VN6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx41Q91VN6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx41Q91VN6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx41Q91VN6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms