Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol9aQ8VDU3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apol9aQ8VDU3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms