Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms