Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brd3Q8K2F0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd3Q8K2F0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms