Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp2Q8K0D2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Habp2Q8K0D2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms