Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB59

Fam161b, Protein FAM161B, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam161bQ8CB59 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam161bQ8CB59 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam161bQ8CB59 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam161bQ8CB59 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms