Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grik4Q8BMF5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms