Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap2lQ7TS74 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141 ms