Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim17Q7TPM3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms