Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tlr13Q6R5N8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr13Q6R5N8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr13Q6R5N8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms