Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med16Q6PGF3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Med16Q6PGF3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms