Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhb9Q6PB60 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhb9Q6PB60 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms