Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bfsp2Q6NVD9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bfsp2Q6NVD9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms