Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20917Q62457 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20917Q62457 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms