Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otol1Q4ZJM7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otol1Q4ZJM7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms