Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syne3Q4FZC9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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