Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc27Q3V036 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms