Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1lQ2KN98 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms