Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Fam47cQ14BE7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Fam47cQ14BE7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Fam47cQ14BE7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Fam47cQ14BE7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam47cQ14BE7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Fam47cQ14BE7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam47cQ14BE7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Fam47cQ14BE7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam47cQ14BE7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Fam47cQ14BE7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam47cQ14BE7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Fam47cQ14BE7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Fam47cQ14BE7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam47cQ14BE7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Fam47cQ14BE7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms