Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NeblQ0II04 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NeblQ0II04 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NeblQ0II04 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NeblQ0II04 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NeblQ0II04 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NeblQ0II04 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NeblQ0II04 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NeblQ0II04 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms