Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Col17a1Q07563 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Col17a1Q07563 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Col17a1Q07563 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms