Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf9Q07105 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms