Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg2Q03517 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scg2Q03517 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms