Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Htr1fQ02284 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms