Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx2Q00262 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms