Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbbp6P97868 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbbp6P97868 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms